La faune du Burundi reste riche et variée à cause de la diversité des biotopes. Elle est composée des vertébrés relativement bien connus et des Invertébrés très peu étudiés. Les vertébrés comprennent les mammifères, les oiseaux, les reptiles, les amphibiens et les poissons avec environ 1202 espèces.
Les reptiles constituent un groupe peu étudié. Actuellement, seulement 80 espèces sont connues dont 49 espèces pour les serpents. Les Chameleonidae avec 7 espèces viennent en deuxième position et sont essentiellement localisées dans le Parc National de la Kibira. Les tortues restent aussi importantes, 9 espèces dont 7 du genre Pelusios.